一文了解外泌体研究的基础背景

lyw 66 2026-02-09 15:33:32

外泌体

 

是一种由细胞分泌的直径在30-200 nm的单层膜小泡,富含蛋白质、脂质、核酸和糖复合物,具有明显的分子异质性。外泌体的产生是一种蛋白质的质量控制机制,具有多种生物活性,可以重塑细胞外基质,进行细胞间的信号和分子传递,与发育、免疫、组织稳态、癌症和神经退行性疾病等人体健康的诸多方面密切相关。另外,病毒也可以借助外泌体进行病毒颗粒的组装,或借助外泌体产生免疫逃逸。目前基于外泌体的相关特性,已被用来作为多种疾病的治疗工具。

01

外泌体的早期研究与定义

在对分泌出来的囊泡中相关的ATP酶、核酸酶的研究中,考虑到分泌出来的囊泡具有一定的生理功能,Trams等人对囊泡分泌进行了定义,认为囊泡的分泌是细胞普遍具有的功能而不局限于特定的细胞类型,并将囊泡按照直径大小分为约40 nm左右,具有丰富的细胞来源的蛋白质、核酸、脂质和糖复合物的外泌体,和大于500 nm的微泡,其中微泡的物质组成与细胞成分更为相似。这两种囊泡在收集过程中离心力的大小也不同,微泡在10,000 xg 30 min ,外泌体则是70,000-100,000 xg 90-120 min。

20世纪60年代,Bonucci和Anderson等人发现了约100 nm左右、由软骨细胞分泌的小泡,在他们的早期研究中,认为这些囊泡起始了羟基磷灰石晶体的形成,并且从细胞膜上通过出芽方式形成并分泌。与此同时,Wolf等人也报道了血小板能释放一些小的细胞外囊泡,具有重要的凝血作用。这些研究在后来的实验中得到了进一步证实,新的研究也证实了成骨外泌体在骨和牙齿的沉积中的作用,以及在心血管疾病中,外泌体在动脉和心脏的病理性钙化中也发挥了重要作用。

20世纪80年代,与外泌体相关的其他研究也逐步展开,其中包括Trams等人的胞外酶研究,发现了前列腺/附睾衍生的精液中存在外泌体,这部分外泌体不仅是精子成熟所必需的,而且会将前列腺来源的蛋白质和脂质转移到精子膜上。20世纪80年代早期在转铁蛋白受体从成熟的网织红细胞的质膜上消失的研究中,揭示了外泌体的生物发生是细胞质膜蛋白质质量控制的机制,这一过程包含了转铁蛋白受体的从质膜上的选择性内吞、内体膜上出芽进入内体管腔,以及与质膜融合等过程。

图片

总的来说,前期的研究奠定了外泌体生物学的四个原则,这四个原则也被后续的研究路线所证实:

 

第一,外泌体通过质膜和内体膜出芽产生

 

第二,外泌体可以将信号和大分子传递到靶细胞

 

第三,外泌体的生物发生是蛋白质质量控制的机制

 

第四,外泌体生物学在人类的健康与疾病中发挥着重要作用

02

外泌体的结构与组成

外泌体除了由细胞分泌产生外,还可能通过物理机械力引起的碎裂和密封形成,这些外泌体囊泡可以在各种生物体液或者组织上清中找到,包括脂蛋白颗粒、RNA-蛋白质颗粒以及蛋白质聚集体等。外泌体的密度约为1.1-1.2 g/ml,囊泡的密度受到蛋白质和脂质比率的影响,不同囊泡的蛋白质和脂质比例差异很大。已有研究证实,单个外泌体货物蛋白的表达就可以导致外泌体密度的增加,并且引起外泌体大小和形状的显著变化。此外,外泌体的密度也受到外泌体代谢途径的影响,例如成骨外泌体的羟基磷灰石结晶。总之,外泌体的大小、形状、密度会由特定的蛋白质、脂质、酶以及矿物质含量所决定,因而外泌体的密度是在变化的,不是一个固定的理化特征。

外泌体的性质与纯化方式直接相关。如上所述,外泌体和微泡传统上是基于差速离心来定义的,微泡在1–2次 10000 ×g离心30分钟后获得,而外泌体是通过10000 ×g离心获得的上清液,再进行70,000–100,000 ×g离心90–120分钟而获得。这些收获的颗粒里包含的不仅仅是外泌体,如果起始材料是生物体液(如血浆),则该颗粒可能含有大量乳糜微粒和其他脂蛋白颗粒,特别是受试者最近进食过,颗粒中还可能含有外泌体、大蛋白的聚集体、核糖核蛋白 (RNP) 复合物以及通过细胞膜的机械剪切产生的小微粒体。由于离心力和离心管等物理因素收集了许多小囊泡,一些研究需要通过密度梯度离心进一步纯化外泌体,而其他方法则可以通过使用特定外泌体表面抗原的特异性抗体的免疫亲和纯化来提高外泌体的纯度。

外泌体包含广泛的跨膜蛋白、脂锚定膜蛋白、外周相关膜蛋白和外泌体管腔的可溶性蛋白。外泌体的大小和组成并不均一,富含膜相关的寡聚蛋白质,虽然不会如图包含所有的这些蛋白质,但是外泌体富含四肽、粘附分子、酶、支架、RNA结合蛋白、RNA 、DNA和复合聚糖。

a) 

外泌体膜蛋白

Escola等人证实,某些四肽蛋白 (CD81、CD82、CD37和CD63) 在外泌体中高度富集,而普通血浆和溶酶体膜蛋白则没有。其中,CD81是外泌体中富集程度最高的蛋白质,主要定位于质膜,而内体中富集的CD63蛋白是外泌体富集程度最低的蛋白质。CD81和CD63已成为最常用的外体标记蛋白,以及其他四肽,如CD9。四肽本身不含催化活性,但能促进其他膜蛋白运输、功能、稳定性和低聚过程。四肽介导其他蛋白质的作用得到了外泌体中富含大量四肽相关伴侣蛋、主要组织相容性复合物 (MHC) II类蛋白、免疫球蛋白超家族成员8 (IGSF8) 、细胞间粘附分子-1 (ICAM-1) 、综合蛋白 (SDC1-4) 、整合素以及许多其他蛋白质证据的支持。外泌体中存在整合素在生物医学上具有特别重要的意义,因为这些蛋白在癌转移的迁移前生态位和肿瘤转移的器官向性中起着关键作用。

 

b) 

脂质锚定的外膜蛋白

外泌体表面包含一系列脂质锚定蛋白修饰。包括:许多C端糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白、外核苷酸酶CD39和CD73,精子受体Juno、补体抑制蛋白CD55和CD59以及细胞朊病毒蛋白PrPC和淀粉样异构体PrPSC。这些外泌体表面的脂锚定蛋白在发育和癌症中发挥重要作用,并通过胆固醇部分固定在细胞膜外叶中。

 

c)

 外周表面蛋白受体

外泌体携带外周表面受体,如Wnt蛋白参与信号传递,以及完整的膜货物受体/分选伴侣,如EVI。此外,也包含一些肿瘤坏死因子、转化生长因子β、第一凋亡信号FAS配体和细胞因子等,进一步强化了外泌体作为传递复杂自分泌、旁分泌信号的多种信号平台的观点。另外,外泌体还富含细胞外基质ECM蛋白,在信号传导和粘附中有重要作用。

 

d)

 脂质锚定的内膜蛋白质

外泌体包含内膜富含酰化的脂质锚定蛋白,如异戊二烯化小GTP酶(Rabs、Ras、Rho等)、肉豆蔻酰化信号激酶 (Src) 和棕榈酰化膜蛋白。外泌体内皮层富含蛋白质,作为支架连接其他交联蛋白、分子伴侣和脂质。例如ERM,将质膜蛋白交联到细胞骨架蛋白和其他支架响应信号诱导的磷酸化。突触蛋白是另外一种外泌体支架因子,通过多个蛋白结合基序聚集外泌体蛋白。除了不同的支架蛋白,外泌体内膜还富含分子伴侣,与聚集和错误折叠的蛋白结合,如热休克蛋白HSP90、HSP20、HSP27等。

 

e) 

外泌体是分泌的、膜性的、代谢活性的平台,除了特定细胞分泌的酶,还包含RNA编辑酶、脂肪酶、蛋白酶、糖基转移糖苷酶和代谢酶,能够改变外泌体的内容物,使得外泌体成为不同于细胞的大分子储存库。来源于癌细胞的外泌体由于含有突变的Ras蛋白、受体、透明质酸合成酶-3以及存在RNA干扰相关活性从而具有更大的作用。此外,外泌体还包含了能量代谢的关键酶。

 

f) 

可溶性蛋白质和包涵体

外泌体中某些货物蛋白高度富集,特别是CD81、CD9和CD63。外泌体的生物发生可能涉及细胞质和膜内容物的大量包涵体,只有一小部分外泌体蛋白质显示出活性分选的迹象。在这样的模型下,可溶性蛋白可能很少在外泌体中被结合,并且在外泌体内-细胞融合后可以在受体细胞中自由发挥作用。利用光诱导外体靶向和释放系统,这一原理已被巧妙地用于疾病治疗。

外泌体具有异质性,由外泌体有限的携带能力以及机械力、随机性导致的蛋白质分布不同。单个外泌体的组成是由新生外泌体附近的货物浓度决定的。另外由于基因的差异化表达,抗原递呈细胞分泌的外泌体会富含MHC II蛋白和共刺激蛋白,而其他类型细胞则缺乏相应蛋白。另外环境诱导的基因表达,可能在饮食、昼夜节律、激素、体力活动、感染以及细胞周期等不同阶段形成外泌体的异质性。由于蛋白质复合物的扩散、解离和其他理化过程,细胞质和膜内蛋白质浓度也会随机变化,进一步放大了内体和质膜上蛋白质浓度差异的机制驱动因素。另外,外泌体的变化也可以有由货物的空间排斥所反映,比较大的外泌体货物会占据新生外泌体的空间,影响其他货物蛋白的装载。此外,基因转录也存在着随机波动,导致基因表达的显著细胞间差异,从而影响外泌体的组成。综上,外泌体的异质性不是一个可以或者需要解决的问题,是外泌体生物发生机制的必然结果。

 

g) 

外泌体糖缀合物和脂质

外泌体的最外表面由附着的表面蛋白和某些外叶脂质上的聚糖冠层组成,癌细胞衍生的外泌体又有不同,聚糖特征随着各种糖苷酶和糖基转移酶的表达而变化。例如,一些癌症表达的透明质酸合成酶3水平升高,导致合成长的透明质酸类聚合物,促进癌症生长并驱动外泌体的生物发生。在聚糖冠层之下,外泌体膜包含磷脂酰胆碱 (PC) 、磷脂酰丝氨酸 (PS) 、磷脂酰基乙醇胺 (PE) 、磷脂肌醇 (PIs) 、磷脂酸 (PA) 、胆固醇、神经酰胺、鞘磷脂和许多低丰度脂质。纯化外泌体中脂质的总浓度不同于血浆和其他细胞膜,这些差异可能为外泌体生物发生机制提供线索。

 

h) 

外泌体RNAs

外体含有RNA,可以将这些细胞外RNA (exRNA) 以功能形式转移到其他细胞和组织,从而调节细胞的基因表达。外泌体介导的miRNA转移也扩展了分子生物学的中心法则。

 

i) 

外泌体DNA

外泌体含有DNA,包括单链DNA、双链DNA、基因组DNA、线粒体DNA,甚至逆转录互补DNA。与其他外泌体货物不同,目前尚不清楚是否发生了将特定DNA进行选择性分选的情况。基于外泌体的DNA分泌可能在炎症调节中有助于DNA质量控制,并可能成为癌症、病毒感染或化疗耐药的标志物。

 

上下滑动查看全部

在其他细胞器生物发生途径中,蛋白质是由短肽信号介导识别,运送到同源细胞器中,但在外泌体的蛋白质分类中,则是通过细胞质中的质膜锚定和寡聚蛋白介导外泌体的分泌,比如:TfR的聚集与分选,热休克蛋白的应激诱导与外泌体分选。蛋白质的寡聚化可以诱导质膜蛋白的出芽,但目前没有确定的模型表明寡聚化和质膜结合是如何产生蛋白质出芽的生化信号,也尚不清楚细胞如何限制寡聚物/聚集体的大小,使其不超过外泌体的物理承载能力。


上一篇:外泌体:藏在体液里的 “细胞密语”,这篇终于讲透了!
下一篇:外泌体顶刊综述!Science阐述外泌体的生物学功能与生物医学应用
相关文章
返回顶部小火箭